Covid-19: Review Jejak Pandemi Global

Asal usul dan prevalensi Covid-19

COVID-19 merupakan penyakit yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2 yang pertama kali diidentifikasi pada bulan Desember 2019 di Wuhan, China (Parikesit & Nurdiansyah, 2020). Sejak saat itu, virus tersebut telah menginfeksi lebih dari 770 juta orang dan merenggut lebih dari 6 juta orang korban per bulan Oktober 2023 (Kementerian Kesehatan, 2023). COVID-19 menyebar dengan cepat ke seluruh dunia. Oleh karena itu, penyakit ini ditetapkan sebagai pandemi global oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) (Pusparini, 2020) sehingga COVID-19 menjadi ancaman kesehatan masyarakat karena merupakan virus baru yang tidak dikenali oleh sistem kekebalan tubuh, dan virus tersebut menyebar luas (Cascella et al., 2021).

Sayangnya, belum ditemukan obat yang efektif untuk menyembuhkan pasien dan membuat mereka terbebas dari COVID-19, namun para ilmuwan telah mempelajari virus ini secara menyeluruh untuk mengembangkan vaksin yang secara efektif akan melindungi orang dari COVID-19. Namun, banyak vaksin tidak dapat menjamin perlindungan 100% pada masyarakat karena mutasi virus yang terus menerus (Kirchdoerfer & Ward, 2019). Dengan kata lain, vaksin berperan penting dalam menghasilkan antibodi untuk melindungi tubuh, bukan antivirus yang membuat orang kebal terhadap COVID-19 (Darby & Hiscox, 2021). Hingga saat ini, sudah banyak masyarakat global yang telah mendapatkan vaksin COVID-19 untuk mendapatkan kekebalan (Kementerian Kesehatan, 2023).

Varian SARS-CoV-2

Sebagai virus RNA, SARS-CoV-2 terus bermutasi seiring waktu, seperti halnya semua virus. Mayoritas modifikasi hanya mempunyai pengaruh kecil atau tidak sama sekali terhadap karakteristik virus. Namun, mutasi dapat mempengaruhi sifat virus, seperti seberapa mudah virus menyebar, tingkat keparahan penyakit yang ditimbulkannya, atau efektivitas vaksin, pengobatan terapeutik, instrumen diagnostik, dan tindakan kesehatan masyarakat dan sosial lainnya (Organisasi Kesehatan Dunia, 2021). Hingga saat ini, para ilmuwan telah mengidentifikasi 12 varian baru SARS-CoV-2 hasil mutasi tersebut, antara lain varian alfa (B.1.1.7) dari Inggris, varian beta (B.1.3.5.1) dari Afrika Selatan, varian gamma varian (P1) dari Brazil, dan varian delta (B.1.6.1.7.2) dari India, dan varian omicron (B.1.1.529) dari Afrika Selatan yang dianggap sebagai varian perhatian oleh WHO (Organisasi Kesehatan Dunia) (Cascella et al., 2021). Baru-baru ini, telah muncul varian Pirola (BA.2.86) yang ditemukan pertama kali di Denmark yang menjadi sub varian dari omicron, dan saat ini sedang diteliti di negara US dan Inggris (Looi, 2023). Strain baru virus SARS-CoV-2 yang dianggap sebagai varian yang menjadi perhatian (variant of concern) bahwa virus tersebut menyebar lebih cepat dibandingkan strain aslinya.

Sejarah penamaan SARS-CoV-2

WHO sempat mempertimbangkan nama dewa dan dewi Yunani untuk sementara waktu, namun akhirnya memutuskan untuk tidak menggunakan nama tersebut. Pilihan untuk hanya memberi nomor satu, dua, tiga, dan seterusnya telah dipertimbangkan namun ditolak karena dikhawatirkan akan membingungkan nama-nama virus dalam database urutan genetik yang mengikuti evolusi virus SARS-CoV-2. WHO mengumpulkan para ahli untuk membuat skema penamaan, beberapa di antaranya adalah anggota Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV). Mereka menyetujui ide penamaan alfabet Yunani. Hasilnya, varian virus SARS-CoV-2 penyebab COVID-19 diberi nama oleh ICTV yang mengawasi penamaan spesies virus baru (Branswell, 2021).

Alasan WHO membuat skema penamaan varian SARS-CoV-2 menggunakan alfabet Yunani adalah untuk memudahkan pembahasan, memudahkan peneliti berdiskusi, memudahkan mengingat, dan menghilangkan beberapa stigma yang selama ini melekat pada suatu negara. asal merasa terpojok saat pertama kali muncul varian. Yang dipilih saat ini adalah urutan abjad Yunani yang berisi 24 huruf, namun tidak tahu harus berbuat apa jika habis. Epsilon, Zeta, Eta, Theta, Iota, Kappa, Lambda, Omicron, dan Pirola telah digunakan sebagai nama varian baru virus corona (World Health Organization, 2021).

Penyebaran, transmisi & inkubasi virus SARS-CoV-2

Penularan SARS-CoV-2 juga dapat terjadi dalam bentuk aerosol di udara, permukaan yang terkontaminasi, atau bahkan penularan fecal-oral. Karena penyakit menular ini berkorelasi dengan gangguan kesehatan yang terjadi pada sistem pernafasan, beberapa laporan dari pasien menyebutkan batuk dan kekeruhan kaca paru-paru merupakan tanda-tanda pneumonia berat yang disebabkan oleh SARS-CoV-2. Virus ini diketahui menargetkan sistem pernapasan bagian atas dan bawah. Infeksi virus dimulai dengan menyerang dan bereplikasi di daerah tenggorokan, tempat letak awal saluran napas bagian dalam, sehingga menyebabkan infeksi (Harrison et al., 2020).

Seperti yang diklarifikasi oleh Johansson dkk. (2021), penularan virus mungkin masih terjadi tanpa adanya tanda-tanda infeksi. Penularan SARS-CoV-2 tanpa gejala terjadi ketika orang terinfeksi tanpa adanya gejala, termasuk gejala ringan hingga tidak teridentifikasi. Jenis infeksi ini sulit dideteksi karena memerlukan pengambilan sampel klinis prospektif yang intensif dan penyaringan lebih lanjut dari sampel yang dikumpulkan. Kasus-kasus yang tidak dapat dikenali bahkan menjadi lebih buruk dengan adanya variasi virus. Mereka muncul bersamaan dengan meningkatnya laju mutasi dengan cepat. Melalui rekombinasi dan penularan berkala antar spesies, virus mampu bermutasi secara struktural dan non-struktural (Majumdar & Niyogi, 2021).

COVID-19 yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2 yang berasal dari kelelawar, virus ini menular melalui droplet, terutama pada saat penderita batuk, bersin, atau berbicara, keluarlah droplet kecil dari hidung dan mulut disertai dengan virus (Yiwei, 2020). Masa inkubasi SARS-CoV-2 adalah antara 5 hingga 14 hari (Yang, Xiao, & Ye, 2020).

Sifat orang yang terinfeksi SARS-CoV-2

Saat masa pandemi lalu, kelompok lanjut usia dan kelompok rentan perlu dilindungi dari penyebaran COVID-19. Kebanyakan orang yang terinfeksi SARS-COV-2 tidak menunjukkan gejala atau hanya menunjukkan gejala ringan hingga sedang, dengan gejala mirip flu atau infeksi flu lainnya, sehingga jika kita kehilangan kemampuan untuk mengikuti jejak setiap orang yang pernah terinfeksi SARS-CoV-2, maka proses identifikasi individu yang berpotensi tertular akan sulit (Pusparini, 2020). Namun, karena kebanyakan masyarakat sudah mendapatkan vaksin, COVID-19 sudah menjadi endemi.

Referensi

1. Branswell, H. (2021). The name game for coronavirus variants just got a little easier. Retrieved from https://www.statnews.com/2021/05/31/the-name-game-for-coronavirus-variants-just-got-a-little-easier/
2. Cascella M, Rajnik M, Aleem A, et al. Features, Evaluation, and Treatment of Coronavirus (COVID-19) [Updated 2023 Aug 18]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan-. [Figure, SARS- CoV 2 Structure. Contributed by Rohan Bir Singh, MD; Made with Biorender.com] Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK554776/figure/article-52171.image.f3/
3. Darby, A.C., Hiscox, J.A. (2021). Covid-19: variants and vaccination BMJ 2021; 372 :n771 doi:10.1136/bmj.n771
4. Harrison, A. G. et al. (2020). Mechanisms of SARS-CoV-2 Transmission and Pathogenesis. Trends in Immunology, 41(12), 1100-1115. Doi: https://doi.org/10.1016/j.it.2020.10.004.
5. Johansson, M. A. et al. (2021). SARS-CoV-2 Transmission From People Without COVID-19 Symptoms. JAMA Netw Open, 4(1):e2035057. doi:10.1001/jamanetworkopen.2020.35057.
6. Kementerian Kesehatan. (2023). Retrieved from https://infeksiemerging.kemkes.go.id/dashboard/covid-19
7. Kirchdoerfer, R., & Ward, A. (2019). Structure of the SARS-CoV nsp12 polymerase bound to nsp7 and  nsp8 co-factors. Nature Communications, 10(1). https://doi.org/10.1038/s41467-019-10280-3
8. Looi M. K. (2023). Covid-19: Scientists sound alarm over new BA.2.86 “Pirola” variant. BMJ (Clinical research ed.), 382, 1964. https://doi.org/10.1136/bmj.p1964
9. Majumdar, P. & Niyogi, S. (2021). SARS-CoV-2 mutations: the biological trackway towards viral fitness. Epidemiology & Infection, 142. Doi: https://doi.org/10.1017/S0950268821001060.
10. Pusparini. (2020). Tes serologi dan polymerase chain reaction (PCR) untuk deteksi SARS-CoV-2/COVID-19. Jurnal Biomedika dan Kesehatan. 3. 46-48. 10.18051/JBiomedKes.2020.v3.46-48.
11. World Health Organization. (2021). COVID-19 tests. Retrieved from https://www.google.com/url?sa=i&url=https%3A%2F%2Fwww.who.int%2Findonesia%2Fnews%2Fnovel-coronavirus%2Fnew-infographics%2Fcovid-19-tests&psig=AOvVaw3Ewfjbz1WCZdGo3i20FC0t&ust=1625555384583000&source=images&cd=vfe&ved=0CAsQjhxqFwoTCLD7–2vy_ECFQAAAAAdAAAAABAD
12. World Health Organization. (2021). Tracking SARS-CoV-2 variants. Retrieved from https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
13. Yang, Y., Xiao, Z., Ye, K. et al. SARS-CoV-2: characteristics and current advances in research. Virol J 17, 117 (2020). https://doi.org/10.1186/s12985-020-01369-z
14. Yiwei, H. (2020). Graphics: What’s the difference between SARS, MERS and the novel coronavirus? retrieved from https://news.cgtn.com/news/2020-02-02/Graphics-The-coronaviruses-explained-NKRwd5xXhe/index.html